no tiene absolutamente nada que ver. Insisto en esto para que te quedes totalmente tranquilo: el hecho de que no salga en la TSD no significa que tu pago esté retenido, paralizado o que haya algún problema.
Para entenderlo de forma muy simple, imagina que el INSS funciona con dos departamentos que no se hablan en tiempo real:
El departamento de contabilidad (El que paga): Ellos tienen tu expediente de pago directo aprobado. Cogen el dinero, hacen la lista de transferencias y la envían al banco de España para que llegue a tu cuenta a final de mes. Esto ya está en marcha independientemente de internet.
El departamento de informática (El de la TSD): Es una base de datos puramente informativa. Su único trabajo es "subir el recibo" a la web para que tú lo veas.