Si mueves el fondo a la cartera 2, realizas el traspaso y después vuelves a mover el fondo de origen a la cartera 1, podrás eliminar la cartera 2 si ya no la necesitas. En el fondo de la cartera 1 quedarán los movimientos correspondientes al traspaso de origen y, si no te interesan, siempre podrás eliminarlos.
La aplicación es bastante flexible y permite trabajar de distintas formas. Puedes adaptarla a la operativa que mejor se ajuste a tus necesidades. No se pierde información y, si el resultado no es el que esperabas, siempre puedes borrar los movimientos generados y volver a empezar.
En cualquier caso, antes de hacer pruebas, te recomiendo crear una copia de seguridad de la base de datos. Así podrás experimentar con total tranquilidad, sabiendo que podrás volver al estado anterior en cualquier momento.