Buenas tardes,
Es como si no fuerais pareja entonces, la casa es de los dos al 50%, yo creo que cada uno sólo puede desgravar lo que haya aportado por si mismo, es decir, ninguno podría desgravar por lo que ha aportado el otro.
De este modo, cuando uno ya haya aportado el 50% del precio de la vivienda con sus intereses ya habría pagado su 50% y no podría seguir desgravando aunque siguiera pagando, es más, si sigue pagando sería la parte del otro y se podría considerar una donación y tendría que pagar impuesto por ella.
Hasta aquí lo que yo creo que es teoría, pero no estoy seguro, por otro lado a pesar de lo dicho creo que hacienda puede no tener toda la información y "colar" lo que uno pague aunque su parte ya esté amortizada, lo que no veo en absoluto es que uno pueda desgravarse por lo que haya pagado otro, al no existir sociedad de gananciales.