Deducción de la cotización de Autónomo (Sociedad limitada) y otros epígrafes

Buenas tardes.

Tengo una sobrina, que es autónoma porque es la administradora de una sl, en la cual ella recibe nomina por su cargo y ella se paga la cuota de autónoma, aparte este año 2020 se ha dada de alta en varios epígrafes (Actividades económicas), relacionadas con la formación.

Como la cuota de autónomo es única, esta se resta en rendimientos de trabajo???, (indistintamente de que tenga más actividades económicas).

Gracias.