Fiscalidad por venta de acciones

Tengo dos cuentas de Valores y con acciones de la misma empresa, ¿alguien me podría explicar si vendo las de una cuenta si el calculo a la hora de la declaración de la Renta, es con arreglo al precio de compra de las acciones de esa cuenta o de las que tengo en la otra cuenta que son mucho mas antiguas.
Gracias