Deducción Cuotas Autónomo pagadas por la mutua - Declaración de la Renta

Sí, los 2.000 se aplican siempre, por defecto.

https://www.fiscal-impuestos.com/cuotas-reta-mutua-rendimientos-trabajo-gasto-deducible-rendimientos-actividad-economica.html

https://www.iberley.es/noticias/tributos-incidencia-irpf-pago-cotizaciones-autonomo-mutua-durante-it-31906
Retomo el hilo, yo entiendo que las cuotas abonadas por la mutua son deducibles ya que de no abonarse dejaría de ser autónomo.
Entiendo el mismo caso en un asalariado, la empresa le paga la seguridad social en caso de baja y no por eso pasa a retribucines en especies en su nómina.

En el caso de asalariados, sólo pueden deducir la parte de las cotizaciones que abonan ellos, no la parte, muy superior, que abona la empresa. 
Yo entiendo que lo mismo pasa con los autónomos: si las cotizaciones las paga la Mutua, para ellos son deducibles como gastos de los rendimientos del trabajo... Pero también es un ingreso en especie, puesto que es un dinero que les "regala" la citada Mutua (es una forma de hablar, por aclararlo, ya sé que no es un regalo porque se están pagando cuotas mensuales precisamente para cubrir una eventualidad así). 
Y, en actividades económicas, no es un gasto deducible porque sólo lo son los soportados por el contribuyente, y ese gasto lo ha soportado la Mutua.

 un autónomo societario el cual se lo paga la empresa si que puede deducirlo, pero según tu ejemplo entendería que no ya que se lo paga otro

Discúlpame, no te he entendido muy bien, no entiendo tu frase "un autónomo societario el cual se lo paga la empresa".
Si te refieres a que una empresa sí puede deducir las cuotas del reta de sus socios, desconozco el funcionamiento del impuesto sobre sociedades, no puedo ayudarte en eso, lo siento.
Si te refieres a un autónomo que tributa en IRPF, pero que es socio de una sociedad y es ésta quien paga sus cuotas del reta, él sí puede deducir esas cuotas, pero, por supuesto, el pago por parte de la sociedad es un ingreso en especie que debe declararse. De hecho, son bastante comunes los requerimientos solicitando al autónomo los recibos de pago de esas cuotas; si se pagan desde una cuenta de la empresa, y no una personal del contribuyente, inmediatamente se mandan liquidaciones incluyendo ese importe como ingresos en especie de los rendimientos del trabajo. 

Confirmado, dos declaraciones con deducción de las cuotas pagadas por la mutua.
Una pidieron documentación y mas tarde la dieron por conforme y la abonaron y la otra la abonaron directamente 
Por tanto si que se pueden deducir

V1607-21, de 27-05-21: deducibles, sí, pero también rendimiento de trabajo. Resultado: ingreso de x - gasto de x = 0.

Si a eso me refería,  pero yo te entendía que no se podían deducir al pagarlos la mutua y por tanto la renta cambiaba mucho