Declaracion patrimonio/Declaracion renta conjunta

Buenas tardes. Matrimonio en separacion de bienes presentan declaracion renta conjunta. El, sus ingresos por trabajo unicamente. La conyuge, ingresos por trabajo mas dividendos y ganancias patrimoniales (bolsa). La conyuge presenta declaracion patrimonio (Valencia) con sus bienes privativos, con una cuota a pagar de, digamos 1000euros. La pregunta es...Al haber presentado declaracion de renta en modalidad conjunta, tiene el marido tambien que pagar cuota por la declaracion de patrimonio de su conyuge,..o sea, en vez de 1000, serian 2000...eso es lo que me dice alguien que supuestamente entiende....Agradeceria vuestra opinion. Gracias