Primero miraria si en los Datos Fiscales , si aparece el 50% como titular , en este caso lo mas seguro es que emitan una paralela corrigiendo este dato , a la que darias la conformidad y te evitarias la complementaria.
Si no aparece nada en los Datos Fiscales ,presentaria la Complementaria en cualquier entidad bancaria y pagando la diferencia a favor de la Hacienda. Los interese te los girara la AEAT posteriormente , esto si ya has recibido la devolucion solicitada o ya se en cuentra en tramite de devolucion.
Si aun no esta tramitada la declaracion en la Casilla 123 , tienes para indicar que la devolucion esta pendiente y que ha de ser inferior , marcas esta casilla.En este caso como no debes pagar nada , la presentas en tu Delegacion de Hacienda.
Me imagino que habras tenido un error en 720-723 por 120-123 , ya que la Complementaria es hacre una duplicada de la presentada salvo las cifras del error que han de ser la correctas.
Todas las Complementarias han de salir a pagar , ya que ello es la funcion de este tipo de declaraciones , cuando es a favor del contribuyente , se ha de solicitar mediante una Solicitud de Ingresos Indebidos.
Saludos