Aparte de posibles comisiones de traspaso, suscripción, reembolso y cambio de moneda, el problema de los traspasos es que te tiras uno o varios días fuera del mercado.
Lo que no acabo de entender, salvo el factor psicológico de ver uno de tus fondos en pérdidas, es el motivo de semejante operación.
Un ejemplo de lo que propones es que tuvieras una cartera con dos fondos:
50% Fondo A, con 10% de ganancias.
50% Fondo B, con 4% de pérdidas.
Y tu situación ideal sería tenerlos en la misma proporción, pero ambos con 3% de ganancias.
Si mañana, por lo que sea, tienes que reembolsar una parte de esos fondos, con la primera opción puedes reembolsar un mix de los dos fondos, de tal forma que se compensen pérdidas con ganancias, no pagando nada a Hacienda (de momento). Y luego podrías hacer un traspaso para volver a dejarlos 50/50, eso sí, cumpliendo ciertas reglas si reembolsas un fondo con pérdidas.
Sin embargo, con tu situación ideal pagarías impuestos sobre el 3% de las ganancias, sin posibilidad de evitarlo, obligándote a reembolsar un importe mayor para cubrir la retención de impuestos.
Al no tener que pasar por Hacienda en los traspasos, con fondos de inversión es mejor tener las rentabilidades desiguales.