Bueno, tampoco hay que descartarlo de entrada, primero calcula cuánto es la plusvalía y luego decide. La plusvalía es el valor de transmisión (o sea, el valor que escrituréis en la donación), menos el valor de adquisición (es decir, el valor de escritura de la herencia). Esa diferencia es la que tributa como ganancia patrimonial (es decir, 19% hasta 6000 euros, 21% el resto). Hay unos coeficientes reductores para amortiguar el efecto de la inflación, el cálculo exacto lo puedes simular con el programa PADRE.
Por tanto interesa que el valor de donación no sea mucho mayor que el declarado en la herencia, pero tampoco puedes poner un valor claramente inferior al precio de mercado pues Hacienda te lo revisará. Si heredasteis en 2006 no han transcurrido muchos años y por tanto no debería haber subido mucho de precio, más con la situación actual.
Si el valor a pagar por la plusvalía no es muy elevado siempre podríais acordar que tú hicieras frente a él. Sería un gasto más a añadir al impuesto de donaciones y al notario.
Otra alternativa sería que en vez de donártelo te lo vendiera, en ese caso la tributación de la plusvalía sería la misma para ella, pero tendría dinero para pagarla. Igualmente Hacienda no permite venderlo por un precio claramente inferior al de mercado.
Otra opción sería que aunque en el papel siguiera figurando al 50%, que en la práctica tú fueras el que disfrutara de ella y por tanto tú sufragaras todos los gastos. Sería un acuerdo extraoficial, partiendo de la base de que os llevéis bien y confiéis el uno en el otro, claro :D Si realizas inversiones en la casa entiendo que no quieras que esa mitad pasara a los herederos de tu hermana, en ese caso bastaría con que ella en su testamento te legue a ti esa mitad.