Hijos computar por entero cuando madre no trabaja?

Vivo con mi novia, no pareja hecho y no matrimonio.

Cuando ella no esta trabajando, cuanto puedo deducir?

Tenemos 2 hijas <3 anos.

5100 EUR (2 hijas) + 5600 EUR (<3 anos y 2 hijas)
= 100%

O puedo solo deducir 50% de este cantidades?

(1 de dos hijas tiene discapacidad, solo 1 pulmon, no puedemos usar guarderia, entonces la madre no puede trabajar.)

te diría que el mínimo por descendientes hay que prorratear; luego solo podrías incluir la mitad, porque declaración conjunta no puedes presentar al no estar casado.
Aparte, los 100 euros/mes por menor de 3 años a partir del 1 de enero de 2023 creo que los van a dar a la madre sin que tenga que estar trabajando, requisito que existe actualmente.
¿tiene tu hija reconocida la discapacidad, o tienes posibilidad de solicitarla? Porque entonces podrías añadir desde la fecha de reconocimiento:
* el mínimo por discapacidad del descendiente (3.000 euros anuales, por discapacidad del contribuyente igual o mayor del 33 por 100. 9.000 euros anuales, si el grado de discapacidad es igual o superior al 65 por 100. + 3.000 euros anuales, si necesita ayuda de terceras personas o movilidad reducida). Iría prorrateado entre los 2.
* los 100 euros/mes de deducción por descendiente con discapacidad, que sí se puede ceder al otro padre/madre https://sede.agenciatributaria.gob.es/Sede/ayuda/manuales-videos-folletos/manuales-practicos/irpf-2021/capitulo-18-cuota-liquida-cuota-autoliquidacion/resultado-declaracion/deducciones-familia-numerosa-personas-discapacidad-cargo/cesion-derecho-deduccion.html
* si tiene discapacidad, se tiene derecho al título de familia numerosa (la hija con discapacidad computa por 2, luego es equivalente a 3 hijos). Según la Comunidad, el título lo puede solicitar solo uno con los hijos, o ambos. Fiscalmente son 100 euros más al mes, que igualmente se puede ceder, y otros beneficios como ahora mismo la tarifa reducida de la electricidad, bono del gas,etc que no es moco de pavo.

Estamos esperando a valoración. Pero ellos me dicen que el proceso entero es más o menos 8 meses.

bueno, si reconocen una discapacidad, los beneficios fiscales se aplican desde la fecha que ponga en la resolución, que suele ser cuando lo hayáis solicitado o hagan el primer chequeo. Entonces puedes solicitar la rectificación de la declaración de 2022 por ejemplo para que se incluya la circunstancia.
Y si la reconocen y entonces solicitas el título de familia numerosa lo mismo, aplican los beneficios fiscales desde que se presenta la solicitud una vez concedan el título.