IVA de una factura de hace 3 años y pico

EN 2012 hemos declarado en una sociedad una factura por compra de inmobilizado de 2008. Antes de los 4 años que marca la ley para deducirse el IVA. El caso es que me surgen una serie de dudas de las consecuencias de dicha deduccion. El importe es importante y la demora no ha sido un descuido, sino que por razones que no vienen al caso, ha sido intencionado.

Las dudas que me surgen es si deberia presentar un modelo 347 del año 2008 y sus consecuencias o bien, simplemente contabilizar la factura, deducir el 16% de IVA y ver que pasa.

ALguien tiene alguna opinion al respecto? Alguien se ha encontrado con dicho problema.

saludos
juan