Que te des de baja de autónomo no implica que automáticamente se paralice tu asignado IMV (igual que tampoco lo hace el darte de alta en autónomos o ponerte a trabajar de asalariado), porque el IMV que te asignan depende de tus ingresos declarados en el IRPF y las revisiones del IMV.
Si durante 2024, 2025 y 2026 has estado de autónomo y tuviste ingresos por dicha actividad económica, posiblemente tu IMV habrá ido variando en la revisión de octubre del 2025 (respecto a lo que comenzaste a cobrar en enero 2025) y seguramente también cambiará en la de octubre de este 2026 (respecto a lo que comenzaste a cobrar en enero 2026); lo que si ocurrirá es que ahora en la revisión de octubre del IMV computarán tus ingresos del 2025 declarados en el IRPF y determinarán que importe te corresponde realmente de IMV para este año 2026 (como a todo el mundo nos harán, claro).