Somos humanos, cometemos errores ... y si, Hacienda computa eso así como indicas actualmente (el saldo al 31 de diciembre o el saldo medio del 4T, el que mayor resulte de ambos, y repartido en partes iguales entre los titulares)
No obstante, insisto en que sería más sencillo y evitaría problemas en tu caso particular y en el de otras personas en situación parecida, que tú tuvieras tu propia cuenta y tu madre la suya, independientes entre sí y ambas con un único titular, y en todo caso tú estés de autorizado en la suya y ella de autorizada en la tuya; esto evita el problema de Hacienda y su imputación de saldos, evita que un embargo bancario de uno afecte al otro y os permite incluso poder domiciliar recibos de uno en la cuenta del otro si fuese necesario... es un muy consejo de planificación financiera y fiscal que te regalo y espero que cualquiera que lea esto valore correctamente.