Depende de cuáles sean las condiciones para las comisiones. Está claro que hay comisiones que se liquidan al momento, por ejemplo las transferencias (como ya te comenté). Si la nueva tarifa entra en vigor en diciembre, en cuanto hagas una transferencia te la cobran. Lo mismo sucederá, si se trata de que te expidan un cheque, por ejemplo.
Ahora bien, hay comisiones, por ejemplo la de mantenimiento, que varían en función del saldo medio en la cuenta durante el semestre anterior o del número de compras que hagas con tu tarjeta. En tal caso, hasta que venza el semestre no te pueden cargar la comisión por ser variable. Lógicamente, esa comisión la cargarán a semestre vencido, en tu caso en junio.
El silencio es hermoso cuando no es impuesto.