Declaración gastos mantenimiento y mejora piso alquilado

Mi mujer y yo tenemos una propiedad inmobiliaria en alquiler. Durante el año incurrimos en gastos de mantenimiento o mejoras para los cuales tenemos facturas en materiales y servicios, que unas veces las hacen a nombre suyo y otras a nombre mío. todos los años hacemos la declaración individual (nunca nos interesa la conjunta)
Para declarar los costes hay que imputar a cada uno aquellos según a quien se ha realizado la factura? 
Hasta el momento estaba sumando todas las facturas y ponderando al porcentaje de propiedad del inmueble.
Gracias por la ayuda.

Prorratéalo conforme al porcentaje de propiedad del piso de cada uno. 

Te refieres a prorratear la suma total? Entonces lo he estado haciendo bien. Gracias