Como corregir un error del modelo 130 del trimestre pasado

Spy autonomo y he contratado una gestoria y me acabo de dar cuenta de que cometieron un error en el modelo 130 del tercer trimestre, han calculado mal el 20%, han puesto un monto mayor por lo que he pagado más. ¿Como solucionarlo? Todavía no he declarado el modelo 130 del cuarto trimestre 

Pagar más del 20 % mínimo obligatorio es perfectamente posible. Así que solo por eso, para hacienda no hay error.
Por otra parte, el modelo 130 es recapitulativo anual. Cada trimestre arrastra todo lo que lleves ya declarado en los anteriores, incluidas las cuotas satisfechas.
Así, si el 3T te salió "en demasiado", este 4T seguramente te saldrá en "mucho menos". El resultado anual, que siempre es provisional, te queda apañado.
Incluso aunque al final te salgan cuotas en exceso, la regularización procede hacerla mediante la declaración anual IRPF, que es donde ya pasas cuentas definitivas con hacienda.

Donde hay que ir con ojo es en los trimestrales del IVA, ya que cada trimestral es "autoconclusivo". Un error en un trimestral hay que arreglarlo en ese y solo ese trimestral (declaración complementaria o solicitud de ingresos indebidos).