Quieres decir que en la escritura de venta esta con el valor de 72.000 euros y realmente tu solo has cobrado 40.000 euros ?
Parece que este terreno venia de una herencia, donde el valor asignado en dicha herencia es de 72.000 euros.
En tu Declaración del IRPF donde tienes que declarar esta venta, tendrás que consignar como valor de venta, lo que figure en la escritura de venta (72.000 euros) y como el valor de adquisición es el mismo 72.000 euros , la ganancia o perdida en esta operación es CERO.
A parte de la venta, tendrás que pagar el Impuesto de Plusvalía Municipal por incremento de valor de los terrenos, que son a tu cargo y cuyo importe minora el valor de venta en el IRPF, con lo que si tendrás una perdida a declarar por este pago de impuesto municipal.
El efecto de esta anomalía de consignar un valor superior en escritura de venta que lo realmente cobrado, lo tienes en que esta diferencia de 32.000 euros que lo podrías declarar como perdida en el IRPF, no lo puedes hacer y en su momento compensar con otras ganancias.
No entiendo que hayas admitido estas cosas.
Saludos