Soy un profesional del sector, y además en mi familia se ha dado la misma situación. Te explico: efectivamente, si era un seguro de la empresa (supongo que del convenio), tributa en la renta como rendimiento del trabajo, es decir, todo que venga de parte de la empresa al trabajador, siempre tributa como rendimiento del trabajo. En el caso que expones (igual que mi padre) los 41.000 euros van integros a rendimientos del trabajo, por lo que habrá que sumar las nóminas, pensiones, más los 41.000 euros del seguro, por lo que ese año tu padre (y el mio) se irán a un tramo muy alto de la escala de gravamen y tendrán que pagar un pico. Mi consejo es que se guarde por lo menos 10.000 euros para pagar la renta del año siguiente. Así es la ley. Así que a aguantar toca. Espero que tu padre este bien. Un saludo.
David (http://www.miasesorfinanciero.com)