Por curiosidad, ya está solucionado.
Hice el ingreso de la parte negativa que tenía en "cuenta (EUR)" y ya me aparece la misma cantidad en "margen libre" como en "cuenta (EUR)" por lo que he podido retirar sin problemas la cantidad pretendida.
Un poco extraño me ha parecido todo pero bueno, solucionado que es lo importante.
Un saludo.