IVA aplicable a compra de hace 10 años

Hola a todos,tengo una duda respecto al IVA a aplicar:

- SL dedicada al transporte que construye nave industrial para su propio uso.

- En el año 2001 se le compra por 10 millones de pesetas y desde ese moment el comprador dispone de ella.

- En el clausulado del contrato de compraventa dice: " En el acto de la protocolización en escritura pública se devengará el IVA (o impuesto equivalente), y al tipo impositivo que estuviere vigente.

Mis dudas:

a) ¿Es correcto escriturarla (2011) en 10 millones de pesetas (60.000 euros)? ¿puede haber problemas?

b) ¿Paga IVA o TPO?

c) ¿La SL vendedora puede repercutir el IVA 10 años después de haber entregado la nave?.

Un saludo y gracias por adelantado.