Baja durante un contrato de interino

Buenos días. Mi consulta es la siguiente. Tengo un contrato de interinidad sustituyendo una baja maternal. Pero me he quedado embarazada y aunque en teoría mi contrato acaba a mediados de octubre, mi embarazo es de alto riesgo y estoy trabajando bastante lejos de casa y me paso 10 horas sentada. Mi médico podría darme de baja en este tipo de contrato?