Acceder
Cómo llevar la contabilidad siendo autónomo: libros obligatorios, cuentas contables y Verifactu

Cómo llevar la contabilidad siendo autónomo: libros obligatorios, cuentas contables y Verifactu

Qué libros registro está obligado a llevar un autónomo según su régimen fiscal, cómo clasificar ingresos y gastos, y qué cambia con Verifactu, obligatorio para autónomos desde el 1 de julio de 2026. Una guía para cumplir sin complicarte y sin pagar de más.
Llevar bien la contabilidad como autónomo no solo es obligatorio, sino clave para evitar sanciones, ahorrar en impuestos y tener el control de tu negocio.

En este artículo te explico qué libros contables debes llevar, cómo organizar tus cuentas contables, qué te exige Verifactu y cómo hacerlo sin complicarte. 

En corto: lo que un autónomo está obligado a llevar depende de su régimen fiscal, y en estimación directa son libros registro, no contabilidad de empresa: ingresos, gastos y bienes de inversión, más el de provisiones de fondos y suplidos si tu actividad es profesional. En módulos, en general no hay libros contables salvo que apliques IVA. Y hay una novedad que ya no es futura: Verifactu es obligatorio para los autónomos desde el 1 de julio de 2026 —desde el 1 de enero de 2026 para las sociedades—, así que el programa con el que factures tiene que cumplir el reglamento.

¿Por qué es importante llevar la contabilidad como autónomo?

Tanto si acabas de darte de alta como autónomo como si llevas tiempo gestionando tu negocio, saber cómo llevar la contabilidad de un autónomo es imprescindible. No solo por obligación legal, sino porque te permite:

  • Tener una visión clara de tus ingresos y gastos.
  • Optimizar tu fiscalidad y deducir lo máximo posible.
  • Prepararte para posibles inspecciones  y saber qué hacer si Hacienda te pide facturas de hace años.
  • Tomar decisiones con datos reales.

Ahora bien, no todos los autónomos tienen las mismas obligaciones contables. Vamos a verlo.

Libros contables obligatorios para autónomos

Infografía con los libros contables obligatorios, requisitos de facturación y cuentas básicas que debe conocer todo autónomo.
Conviene empezar deshaciendo un equívoco: un autónomo en estimación directa no lleva «contabilidad» en el sentido de una empresa, con asientos y plan contable. Lleva libros registro, que es otra cosa y bastante más sencilla. Dependiendo del régimen fiscal y de si tu actividad es empresarial o profesional, estos son los que te corresponden:
Régimen fiscal de autónomo
Libros contables obligatorios
Estimación directa simplificada
Libro de ingresos, libro de gastos y libro de bienes de inversión. Si tu actividad es profesional, además el libro de provisiones de fondos y suplidos
Estimación directa normal
Todos los anteriores más contabilidad completa si supera los 600.000€
Estimación objetiva (módulos)
No requiere libros contables, salvo si se aplica IVA (entonces libro de facturas emitidas y recibidas)
El libro de provisiones de fondos y suplidos es el que más se olvida, y es precisamente el que la Agencia Tributaria exige a las actividades profesionales en estimación directa, tanto normal como simplificada. Si eres abogado, arquitecto, consultor o cualquier otro profesional que adelanta pagos por cuenta de sus clientes, ese libro te toca aunque lleves años sin abrirlo.

Eva María Filgueiras Herrera
Experta en Banca empresas
Aunque no estés obligado, llevar una contabilidad básica siempre te ayudará.

Verifactu: qué te obliga a hacer desde julio de 2026

Es el cambio más relevante de los últimos años para la contabilidad del autónomo, y ya no es una advertencia a futuro. El Reglamento de sistemas informáticos de facturación, conocido como Verifactu, obliga a que el programa con el que emites facturas genere un registro de facturación íntegro, trazable e inalterable por cada factura.

Las fechas, según la Agencia Tributaria tras la modificación introducida por el Real Decreto 254/2025, son estas:

  • 1 de enero de 2026 para los contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades, es decir, las sociedades.
  • 1 de julio de 2026 para el resto de empresarios y profesionales, es decir, los autónomos.

En la práctica, lo que te toca comprobar es una sola cosa: que tu programa de facturación cumple el reglamento. Si facturas con una hoja de cálculo o con un documento de texto, eso ya no vale. Y si usas un software, el fabricante debe tener la declaración responsable de que su sistema se ajusta a la norma: pídesela, porque la responsabilidad de facturar con un sistema conforme es tuya.

Una aclaración que conviene tener clara, porque se mezclan constantemente: Verifactu no es lo mismo que la factura electrónica obligatoria entre empresas y profesionales. Son dos obligaciones distintas, de normas distintas y con calendarios distintos. Verifactu va del programa con el que facturas; la factura electrónica B2B va del formato en que te intercambias las facturas con tus clientes.

Cómo llevar la contabilidad de un autónomo paso a paso


1. Clasifica tus ingresos y gastos

Debes tener bien identificadas las cuentas contables de autónomos, al menos por categorías básicas:

  • Ingresos por ventas
  • Gastos deducibles: suministros, transporte, formación...
  • Cuotas de autónomo y seguridad social
  • Inversiones (ordenador, maquinaria...)

2. Emite y registra tus facturas 

Con Verifactu ya en vigor, lo que necesitas no es «una herramienta que esté preparada» a futuro, sino una que cumpla hoy. Algunas soluciones de facturación integradas en cuentas de empresa se adaptaron antes de la fecha límite; es el caso de Qonto y su integración con Verifactu. Sea cual sea la que elijas, la comprobación es la misma: que el proveedor declare expresamente que su sistema cumple el reglamento. 

3. Usa un software que te lo ponga fácil 

Olvídate de hojas de Excel eternas. En este artículo recopilamos los mejores softwares para empresas. Nuestra recomendación es usar una solución que incluya:

  • Cumplimiento del reglamento Verifactu, por escrito
  • Emisión y registro de facturas
  • Gestión automática de gastos
  • Integración bancaria
  • Panel intuitivo y asesoramiento fiscal

Qonto: 5% de remuneración en su Cuenta de empresa
9.0
Qonto: 5% de remuneración en su Cuenta de empresa
  • 5% de remuneración durante 2 meses en planes essential, business y Enterprise.
  • Prueba Qonto gratis 30 días.
  • Con transferencias gratis, tarjetas, subcuentas, pago de impuestos y financiación.

¿Cuál es la cuenta contable de los autónomos? 

En contabilidad, cada ingreso o gasto se asigna a una "cuenta contable". Aunque no estás obligado a llevar una contabilidad con código contable si estás en estimación directa simplificada, sí conviene tener claro cómo clasificar los movimientos. Algunas cuentas típicas serían:
Código
Cuenta contable
Ejemplo
700
Ventas
Factura emitida por un servicio
622
Reparaciones y conservación
Arreglo de un ordenador
629
Otros servicios
Hosting web, software de gestión
623
Publicidad y propaganda
Campañas online

¿Qué errores debes evitar como autónomo?

A lo largo de los años hemos visto muchos fallos comunes. Aquí van los más importantes:

  • No guardar justificantes de gastos.
  • No revisar los libros registro antes de presentar impuestos.
  • Mezclar gastos personales con profesionales en la misma cuenta, que es lo que convierte una revisión de diez minutos en una tarde entera.
  • Olvidar el libro de provisiones de fondos y suplidos siendo profesional.
  • Dar por hecho que tu programa de facturación cumple Verifactu sin haberlo comprobado.

Hazlo fácil, hazlo bien

Llevar la contabilidad de un autónomo no tiene por qué ser complicado. Hoy existen herramientas que te lo ponen fácil, te ahorran tiempo, cumplen con la ley y además mejoran tu organización.

Qonto no es solo una cuenta de empresa, es una solución de gestión para autónomos: integración contable, facturación y control de gastos desde una sola app. Puedes consultar sus condiciones y la promoción vigente en la ficha del producto.
¿Quieres probar Qonto de forma gratuita?

Preguntas frecuentes 

¿Un autónomo puede llevar su contabilidad en Excel?

Para llevar los libros registro, sí. Para emitir las facturas, no: desde el 1 de julio de 2026 los autónomos están obligados a facturar con un sistema informático que cumpla el reglamento Verifactu, y una hoja de cálculo no lo cumple. Puedes seguir usando Excel como apoyo para tus cuentas, pero no como programa de facturación.

¿Qué libros contables son obligatorios?

Depende del régimen fiscal. En estimación directa, el libro de ingresos, el de gastos y el de bienes de inversión; si tu actividad es profesional, además el libro de provisiones de fondos y suplidos. En módulos, en general no hay libros contables salvo que apliques IVA.

¿Cuál es el mejor software de contabilidad para autónomos?

No hay uno mejor para todos: depende de si necesitas solo facturar o también llevar los libros y presentar modelos. El filtro de partida, desde julio de 2026, es que cumpla el reglamento Verifactu. Qonto, por ejemplo, no es un software de contabilidad sino una cuenta de empresa con facturación integrada, útil si quieres banco y facturas en el mismo sitio.

¿Es obligatorio tener cuenta bancaria separada?

Para un autónomo persona física no es obligatorio por ley tener una cuenta separada, pero sí muy recomendable: evita mezclar movimientos, facilita justificar los gastos deducibles ante Hacienda y te ahorra trabajo al cuadrar los libros registro.
Descubre la mejor opción de financiación para tu negocio

Préstamos y financiación para empresas

  • Identifica las mejores fuentes de financiación.
  • Prepara tu negocio para atraer inversores.
  • Maximizar las oportunidades de crecimiento de tu empresa

Accede a Rankia
¡Sé el primero en comentar!
¡Únete a la comunidad de Rankia Business!

Suscríbete y recibe en tu correo las mejores novedades y productos financieros para empresas.