IVA en anticipos

Una empresa me va a realizar una obra por 3300 euros. Tengo que dar un anticipo para materiales. ¿tengo que pagar este anticipo por transferencia bancaría? ¿Me deben dar una factura de dicho anticipo o el IVA lo aplican al final? ¿Que debo poner en la transferencia como referencia?

Sí a las dos primeras preguntas. La primera admite más posibilidades, excepto el pago en efectivo.

Gracias por su aclaración.
Pero si no me facturan el anticipo diciendo que lo hacen al final, es ya problema de la empresa no? Pues supongo que en factura final vendrá reflejado el anticipo.

Claro, es problrma de la empresa. Tanto la facturación como la repercusión del IVA son responsabilidad de la empresa.
El pago en efectivo sería responsabilidad de ambos.

Gracias. Entiendo entonces que si la empresa no lo hace bien, con tener yo los justificantes de pago basta.

Así es.

Gracias por la aclaración.