Ha respondido al tema
IRPF indemnización seguro colectivo por incapacidad permanente total
Finalmente la Dirección General de Tributos, mediante una consulta realizada a la Agencia Tributaria, me ha respondido que, al tratarse de de un seguro contraído por la empresa obligada por un convenio colectivo, la indemnización se considera como rendimientos del trabajo.
Después de esto, les he realizado una nueva pregunta para ver si se aplica la reducción del 40% por rendimientos obtenidos irregularmente en el tiempo, tal y como se plantea en este caso que aparece en la página de la Agencia Tributaria:
https://www2.agenciatributaria.gob.es/ES13/S/IAFRIAFRC12F?TIPO=R&CODIGO=0128090