Gracias, pero lo tengo muy claro.
Uno de los servicios para llevar la contabilidad online es el siguiente, para quien esté interesado: http://www.crunch.co.uk/
Después también tienes http://www.kashflow.com/
Como dije, a nivel técnico de informática, Hacienda no tiene nada que hacer. Para la conexión a tu servidor, usa un servidor anónimo que no esté en la U.E., ni USA, Canadá, Australia, o sea fuera de países "amigos" de USA o de la U.E. Si quieres mayor seguridad, usa un sistema operativo (Linux o FreeBSD) modificado por tí para no dejar huellas, desde VirtualBox.
Luego, aunque tengas una director nominativo, nunca olvides que cualquier gestión de tu compañía la debes hacer fuera del territorio español, pero no te preocupes porque todos esos gastos (vuelo, hotel, traslado, comida) lo puedes deducir de los impuestos que pagues en UK.
Y por último, no seas tan avaricioso, una vez que ganes suficiente, contratas a un gestor para las operaciones de la compañía, y a un administrador, siempre fuera de España para que la compañía siga siendo fiscalmente británica.