Revinversión de capital procedente de venta, en otra vivienda (residencia habitual)

Buenas tardes,

Se plantea la siguiente operación:

1.-Venta de vivienda por importe X, contrato de arras que por circunstancias varias se termina alargando en el tiempo su ejecución de tal manera que termina elevando a público año y medio después.

2.-Entre tanto no se había elevado a público el contrato, el vendedor adquiere otra vivienda, que se convierte en su primera residencia, por importe "y" suscribiendo un préstamo hipotecario sin haber recibido aun el pago de la anterior.

3.-Finalmente la venta se formaliza muy por debajo de tasación, advertencia de notario etc.....

4.-El importe de la venta se destina en su integridad a la amortización de la hipoteca descrita en el punto 2º.

Mi duda es el encaje fiscal que tiene la operación teniendo en cuenta que el importe que se obtiene de la venta de vivivenda está exento de tributar si dentro de los dos años siguientes se destina a la adquisición de la vivienda habitual. En este caso se ha destinado a la amortización del préstamo, ya que, aunque la vivienda ya estaba vendida y llaves entregadas se demoró en el tiempo la escritura ante notario.

Gracias.