La diferencia estriba en que en las herramientas gráficas no es imprescindible saber programación que por otro lado es como bien dices más flexible.
En cuanto a los links no sé porqué no ha funcionado te los pongo otra vez, el de vídeos es de Visual Chart y el de libros hay un poco de todo.
Vídeos:
http://www.visualchart.com/esxx/education/videos/videos.asp
Libros:
https://www.visualchart.com/MarketMonitor/MarketMonitor.aspx?Page=VC5_PSE_INT&PAGENAME=LIB&MENUNAME=LIB&SEC=LIB&ticket=111
Ninja Trader:
http://www.ninjatrader.com/webnew/support.htm
Libro para desarrollar estrategias con el Strategy Wizard (herramienta gráfica):
http://www.amazon.co.uk/gp/reader/1905641737/ref=sib_dp_pt#reader-link
Saludos
