Hola Catalina,
Bienvenida al blog :)
Has dado en el clavo de uno de los problemas a la hora de valorar por múltiplos, y es precisamente que las empresas que se tengan en cuenta tienen que ser más o menos "comparables". Aquí hay muchos parámetros a tener en cuenta: que estén en el mismo sector y se dediquen a lo mismo, que tengan un modelo de negocio parecido, que tengan un tamaño parecido, etc.
Por eso recomiendo no gastar los múltiplos más que como una manera de hacer un cálculo en 3 segundos de si vale la pena examinar más una empresa o no. Como ejemplo: si una empresa tiene un PER de 120, no le voy a dedicar ni 5 segundos a lo demás.
Un saludo,
AndrésR