Efectivamente, el sistema electoral español favorece a los partidos mayoritarios, no a los minoritarios. Puedes aplicar pacientemente la Ley d'Hondt tomando España como una circunscripción única y se observará que el PSOE y el PP pierden diputados, y los ganan, prácticamente, todos los demás.
Más sencillo: PSOE 43.73% de votos y 48.3% de diputados, el PP 40.1% de votos y 44% de diputados... ¿está claro no?
No es ni bueno ni malo, pero es así.
En cuanto a las causas de los resultados valencianos, digamos que el factor Canal9 pesa más que lo que has comentado, en mi opinión.
saludos, Estilpón